Năm 2007, công ty luật Covingtoh & Burling LLP, đại diện cho quyền lợi của 7 nhà đầu tư Tây Ban Nha - cổ đông của Yukos, đã đệ đơn kiện Nga lên Tòa án Trọng tài Quốc tế Stockholm. Các nguyên đơn yêu cầu chính phủ Nga bồi thường, đề cập đến thực tế là do các hành động của nhà nước và cơ quan tư pháp của Liên bang Nga, họ bị thiệt hại về tài chính. Và, theo thỏa thuận Nga-Tây Ban Nha về bảo vệ lẫn nhau trong các khoản đầu tư, những thiệt hại mà các nhà đầu tư phải gánh chịu do hành động bất hợp pháp của nhà nước phải được bồi thường.
Thực chất của vụ kiện là phía Nga đã cố tình phá sản YUKOS, gây thiệt hại tài chính cho các cổ đông của công ty. Những người được ủy quyền từ Nga, xuất hiện tại trọng tài Stockholm với tư cách bị đơn, đã không công nhận yêu cầu bồi thường, bởi vì, theo quan điểm của họ, ban quản lý Yukos trong một thời gian dài đã trốn nộp thuế với quy mô đặc biệt lớn và vi phạm pháp luật khác. của Liên bang Nga. Đây chính là nguyên nhân gây ra các vụ án hình sự chống lại ban quản lý YUKOS, cũng như phá sản của nó.
Tuy nhiên, Tòa án Trọng tài Stockholm đã đứng về phía các nguyên đơn, ra phán quyết rằng Nga phải trả cho họ 2,7 triệu USD tiền bồi thường cho những tổn thất phát sinh. Số tiền thua lỗ được tính toán dựa trên lượng vốn hóa của YUKOS tại thời điểm phá sản. Phán quyết của tòa trọng tài nhấn mạnh rằng các yêu cầu về thuế chỉ là cái cớ để tịch thu tài sản của Yukos và mục đích thực sự của việc truy tố hình sự ban lãnh đạo công ty không phải là muốn thu thuế một cách hợp pháp mà là để chiếm đoạt công ty. Đó là, tòa án đưa ra kết luận rằng phía Nga cố tình phá sản YUKOS để các công ty nhà nước Rosneft và Gazprom nhận phần lớn tài sản của mình. Cần phải chỉ ra rằng đây đã là phán quyết thứ hai của Tòa án Trọng tài Stockholm, không có lợi cho Nga dựa trên các tuyên bố của các cổ đông Yukos.
Tại sao Nga lại thua kiện trước tòa trọng tài quốc tế? Tất nhiên, người ta có thể đề cập đến một chiến dịch tuyên truyền rầm rộ, kết quả là người đứng đầu cũ của Yukos, M. Khodorkovsky, xuất hiện trong mắt dư luận phương Tây như một người theo chủ nghĩa đối lập, người phải chịu đựng những kết án chính trị và dân chủ của mình. Người ta có thể chỉ ra một thái độ không mấy thiện cảm của giới cầm quyền Thụy Điển đối với Nga. Tuy nhiên, thực tế vẫn là: ở phương Tây, họ tin rằng chính quyền Nga trong vụ Yukos đã vi phạm quyền sở hữu tài sản. Và khái niệm "tài sản" là thiêng liêng ở đó.
Một quyết định tương tự cũng được đưa ra bởi Tòa án Nhân quyền Strasbourg, mặc dù họ thừa nhận rằng cuộc đàn áp Yukos và ban lãnh đạo của nó không có động cơ chính trị, tuy nhiên cũng chỉ ra sự vi phạm quyền tài sản trong việc phân phối lại tài sản của công ty.
